简化基因组测序
简化基因组测序技术是指利用生物信息学方法，设计标记开发方案，筛选特异性长度片段，应用高通量测序技术获得海量标签序列来充分代表目标物种全基因组信息的测序方法。
长链非编码RNA测序
长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），广泛存在于各种生物体内。
基因组目标区域重测序
使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。
多态性标记开发(SNP 分子鉴定 近等基因系）
高通量开发不同个体间的SNP、InDel标记，实现全基因组均匀覆盖，特别适合近等基因系、单片段代换系中相应片段的鉴定。
染色质免疫共沉淀技术测序（chip-seq 组蛋白 转录因子）
将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。